No IFPA as ações de ensino dos cursos e programas previstos devem ser articuladas entre as Pró-Reitorias de Ensino, de Pesquisa e Pós-Graduação e de Extensão. A Pró-Reitoria de Ensino (PROEN) emitirá instruções normativas e orientações técnico-pedagógicas sempre que necessário, com base nas políticas e diretrizes institucionais.

No âmbito do IFPA Campus Breves, o ensino é gerenciado pelo Departamento de Ensino, Extensão, Pesquisa e Inovação, responsável pelo planejamento, coordenação, formulação e ações de políticas de desenvolvimento do ensino no campus em sintonia com a PROEN e os demais setores do IFPA.

O trabalho desenvolvido pela Coordenação de Ensino atua em uma organização sistêmica, que é integração de todos os setores do campus (coordenação de cursos, equipe pedagógica e setores administrativos), assegurando o funcionamento eficiente e eficaz, cumprimento de prazos, manutenção da qualidade e equilíbrio das ações de maneira a proporcionar diferencial nos serviços da instituição.